（策略篇）S5E06: 把文章改成基金实例：基因SNP、肠道微生物、代谢和免疫
承接昨天的一一篇Science：（文章篇）S5E05: 来篇Science提提神，从免疫角度看宿主基因-肠道微生物作用，我们今天再分享一篇文章，方向是：宿主基因CARD通过改变肠道菌群代谢途径调控固有免疫以干预结肠炎恢复。
首先，我们先看肠道菌群和免疫相关的基金：
纳米二氧化钛长期低剂量膳食摄入诱发肠道菌群紊乱进而导致免疫功能异常的机制研究
HMGB1-NLRP3炎症体在UC肠道菌群激活粘膜免疫中的作用及机制研究
粪菌接种物早期干预影响新生仔猪肠道菌群和肠黏膜免疫发育的机制研究
基于Toll样受体家族调控肠道菌群与宿主免疫平衡调节的中医扶正祛邪理论对晚期结直肠癌疗效机制研究
结直肠癌发生过程中肠道菌群与Rig-I介导的免疫调控关系及机制研究
肠道微生物易位对HIV感染慢性免疫激活的调控机制研究
淋巴毒素β受体调节猪肠道免疫和肠道微生物的功能研究
基于宏基因组学探讨附子理中汤对D-IBS肠道微生物-免疫的调节作用
通过“肠道菌群移植”重建粘膜免疫稳态对非酒精性脂肪性肝炎的防治研究
四君子汤多糖的肠道菌群介导免疫作用发挥机制及物质基础研究
入侵害虫红棕象甲与其肠道菌群协同互作的分子免疫机理
基于肠道菌群－宿主共代谢免疫交互网络调控效应研究哮宁口服液干预支气管哮喘的作用机制
呼吸道流感病毒感染导致肠道菌群失衡的免疫学机制研究
岩藻糖在肠道菌群调控肠上皮细胞-T淋巴细胞免疫功能中的作用
针刺调控肠道菌群-宿主代谢免疫交互的Th17/Treg平衡机制研究
大肠癌发生发展中肠道菌群与IL-22免疫介导的网络调控
肠道菌群对肉仔鸡脂类代谢、肠道免疫及其相关基因表达的研究 2012
肠道菌群失调与肺部免疫状态的关系 200801
糖工程营养调控剂对肠道微生物区系和免疫基因表达的影响 2004
红色：2016 蓝色 2015 绿色： 2014
从基金整体来看，肠道菌群失衡、粘膜免疫、中药、代谢等出现频率较高，以中药为例，我们可以学着起个高大上的名字：XXXX复方干预***疾病分子机制：肠道菌群—代谢—免疫调控网络研究。
今天分享的是一篇2016年6月份Nature Medicine的文章：CARD9 impacts colitis by altering gut microbiota metabolism of tryptophan into aryl hydrocarbon receptor ligands.Nat Med. 2016 Jun;22(6):598-605.
（下载链接：http://pan.baidu.com/s/1i47W8QD 密码：ws85）。
今天换种方式，把文章主题和要素等信息提取出来，把这篇文章改写成一个基金：
一. 立项依据中的背景介绍
CARD9是结肠炎易感基因；
CARD9通过激活IL22通路促进结肠炎恢复；
肠道菌群代谢色氨酸产生的代谢物通过AHR调节IL22的产生。
二、 立项依据引出问题和科学假说
CARD9/肠道菌群/色氨酸代谢/IL22/结肠炎这一信号轴是否成立？
三、研究内容：
CARD9与结肠炎易感性及对结肠炎的保护功能。通过检测结肠炎和正常人CARD基因型、构建CARD9敲除小鼠、DSS诱导的结肠炎模型等方法分析CARD与结肠炎易感性及对结肠炎的保护功能
CARD9通过改变肠道菌群分布和IL22分泌影响结肠炎的机制研究。首先分别通过ITS和16S rDNA测序对CARD9敲除组和对照组小鼠肠道菌群中真菌和细菌多样性进行检测，并结合PCA，LEfSe等分析方法对两组差异菌群进行分析；其次将WT和CARD9敲除组小鼠分别移植给WT无菌组（WT-GF）小鼠并用DSS诱导，观察和检测小鼠胰腺炎表型；最后，通过nanostring数字表达谱和ELISA验证的方式对179个炎症因子相关基因的RNA和蛋白进行检测，以明确CARD9通过固有免疫影响结肠炎的分子机制。
CARD9导致的色氨酸代谢/AHR通路异常是导致IL22表达下调及增加结肠炎易感性的分子机制。首先检测色氨酸代谢物和AHR的激活状态，然后分别通过AHR的激活剂Ficz处理和通过移植色氨酸代谢菌群，以观察结肠炎的表型和下游IL22等因子的表达。
四、研究方法：这一部分可以参考文章的材料与方法部分。
这一部分可以选择文章中的部分结果展示：
好了，关于基金的其它内容我们就不一一列举了，祝大家周末快乐！
That’s all. Thank you!
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